近日,我院高洁教授指导的硕士研究生汪钰洁同学在数学与计算生物学领域1区Top期刊《Briefings in Bioinformatics》上发表论文。
汪钰洁同学以一作在线发表论文“A network-based matrix factorization framework for ceRNA co-modules recognition of cancer genomic data, Briefings in Bioinformatics, 2022. doi: 10.1093/bib/bbac154”(影响因子11.6)提出了NSOJNMF算法来识别与癌症相关的ceRNA共模块,以帮助了解癌症内RNA表达模式和潜在分子机制。该方法以网络正则化的方式结合了RNA数据之间的相互作用关系,同时还可以通过稀疏约束和正交正则化约束有效防止多重共线性并产生良好的模块化稀疏解。该工作为未来验证基因组学数据中多种RNA之间的竞争关系影响肿瘤的发展这一观点提供了理论支持和基础。
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